Původní současná zápletka z Assassin’s Creed: Black Flag byla z Resynced vyřazena. Přesto zde ale najdete čtyři mise, které se týkají současnosti a které vás bohatě odmění.
Současná dějová linie série Assassin’s Creed to nemá snadné. Poté, co Ubisoft několikrát vyměnil hlavní postavu a nedokončil příběhy, mnoho hráčů a hráček toho nakonec mělo dost. V novějších hrách byl proto podíl současnosti výrazně omezen, celé paralelní sekvence odehrávající se v moderní době již neexistují.
I vBlack Flag Resyncedbyl původní příběh ze současnosti odstraněn a nahrazen čtyřmi novými, skrytýmitrhlinami v Animu
. Ty vás však odmění silnými zbraněmi a novým příběhem.
Jak najít trhliny Animusu
Abyste mohli tyto trhliny hrát, musíte v každém případě projít hlavní příběh až do určitého bodu. Poslední se odemkne až po epilogu, takže odměnu získáte také až po dokončení příběhu. Trhliny se navíc nezobrazují přímo na mapě ani nemají značku úkolu, musíte je tedy najít sami:
- První trhlina se odemkne po dokončení úkolu
Jeden šílenec
. Nachází se přímo na jih od Great Inagua, na souřadnicích 825,429.

- Druhá trhlina je dostupná po dokončení úkolu
Neodcházej v míru
. Nachází se severně od Nassau na souřadnicích 604,784. - Třetí trhlina se objeví po dokončení úkolu
Všechno je povoleno
. Nachází se na severozápadě ostrova Isla de Sacrificios na souřadnicích 14,559. - Poslední trhlinu lze hrát až po epilogu. Nachází se u ostrova Mysteriosa na souřadnicích 363,176.
Jako odměnu za dokončení všech čtyř trhlin získáte speciální pár pistole-mečů: Ty nejenže způsobují obrovské množství poškození, ale mají také dvě praktické speciální schopnosti:
- Pokaždé, když zabijete nepřítele, utrpí poškození i nepřátelé v okolí.
- Jak již název napovídá, meče mohou také vystřelit dva výstřely z pistole bez spotřeby munice.
I když už v „Trhlinách“ nejsou žádné skutečné sekvence ze současnosti, ve kterých byste se procházeli a prozkoumávali například kancelář Absterga jako v původním Black Flag, přesto „Trhliny“ vyprávějí ucelený a napínavý příběh. Nejlepší je tedy pustit se do nich hned po dokončení hlavního příběhu v jednom kuse.

